中医认为：“大蒜味辛，性温，入药能通五脏，达诸窍，去寒湿，辟邪恶，下气暖中，消谷化肉，杀毒虫”，有“内服治瘟疫，外用散痛肿”之功。现代医学研究证明，大蒜具有抗菌消炎的作用。大蒜中含有一种蒜素，通常以蒜素原的形式存在，在蒜素原酶的作用下，分解为蒜素，发挥其抗菌作用。所以大蒜对痢疾杆菌有较好的抗茵作用，并对金黄色葡萄球菌、肺炎双球菌也有抗菌作用。生用大蒜时抗菌力强于熟用，紫色蒜的抗菌力优于白色蒜。
明代李时珍著的《本草纲目》中记载：大蒜可以“除风邪、杀毒气，治泄泻暴痢及干湿霍乱”。所以，当民间瘟疫流行之时，人们常把大蒜放进饮水中浸泡，以解水中之“毒”。

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